[math] Unique columns as array for CSR sparse matrix
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@@ -16,4 +16,49 @@ sparse_matrix_t *sparse_matrix_new_from_matrix(matrix_t *matrix) {
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sparse_matrix_finalize_row(sparse);
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sparse_matrix_finalize_row(sparse);
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}
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}
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return sparse;
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return sparse;
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}
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}
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bool sparse_matrix_add_unique_columns(sparse_matrix_t *matrix, khash_t(int_set) *unique_columns, uint32_array *array) {
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size_t n = matrix->indices->n;
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uint32_t *indices = matrix->indices->a;
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kh_clear(int_set, unique_columns);
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size_t i;
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for (i = 0; i < n; i++) {
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uint32_t col = indices[i];
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int ret;
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kh_put(int_set, unique_columns, (khint_t)col, &ret);
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if (ret < 0) {
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return false;
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}
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}
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uint32_array_clear(array);
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uint32_array_resize(array, kh_size(unique_columns));
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khint_t k;
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kh_foreach_key(unique_columns, k, {
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uint32_array_push(array, (uint32_t)k);
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})
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return true;
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}
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uint32_array *sparse_matrix_unique_columns(sparse_matrix_t *matrix) {
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khash_t(int_set) *unique_columns = kh_init(int_set);
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uint32_array *ret = uint32_array_new();
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if (sparse_matrix_add_unique_columns(matrix, unique_columns, ret)) {
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kh_destroy(int_set, unique_columns);
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return ret;
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}
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kh_destroy(int_set, unique_columns);
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uint32_array_destroy(ret);
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return NULL;
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}
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@@ -7,5 +7,7 @@
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#include "matrix.h"
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#include "matrix.h"
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sparse_matrix_t *sparse_matrix_new_from_matrix(matrix_t *matrix);
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sparse_matrix_t *sparse_matrix_new_from_matrix(matrix_t *matrix);
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uint32_array *sparse_matrix_unique_columns(sparse_matrix_t *matrix);
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bool sparse_matrix_add_unique_columns(sparse_matrix_t *matrix, khash_t(int_set) *unique_columns, uint32_array *array);
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#endif
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#endif
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Reference in New Issue
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